Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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