Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF9P41273 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.7 ms