Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms