Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms