Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRABP1P29762 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRABP1P29762 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRABP1P29762 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRABP1P29762 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms