Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YY1P25490 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YY1P25490 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YY1P25490 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YY1P25490 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YY1P25490 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YY1P25490 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YY1P25490 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms