Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms