Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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