Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPN1P15169 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPN1P15169 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms