Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI2P10070 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI2P10070 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms