Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms