Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms