Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP9BO43861 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms