Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms