Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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