Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms