Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms