Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms