Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms