Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP2Q9UDT6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms