Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms