Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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COPS7AQ9UBW8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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COPS7AQ9UBW8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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