Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKIRAS1Q9NYS0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms