Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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