Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms