Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SALL1Q9NSC2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL1Q9NSC2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms