Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms