Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms