Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms