Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms