Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms