Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBL7Q96S82 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms