Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms