Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms