Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms