Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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