Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms