Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL22A1Q8NFW1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms