Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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