Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms