Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBRM1Q86U86 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms