Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM46CQ5VWP2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms