Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms