Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms