Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms