Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms