Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms