Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms