Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms