Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms